UgaldeLab | Microbial Data Science
UgaldeLab | Microbial Data Science
Contacto
Miembros
Publicaciones
Español
English
2
Annotating unknown species of urban microorganisms on a global scale unveils novel functional diversity and local environment association
J. Wu
,
D. Danko
,
E. Afshinnekoo
,
D. Bezdan
,
M. Bhattacharyya
,
E. Castro-Nallar
,
A. Chmielarczyk
,
N.H. Hazrin-Chong
,
Y. Deng
,
E. Dias-Neto
,
A. Frolova
,
G. Mason-Buck
,
G. Iraola
,
S. Jang
,
P. Łabaj
,
P.K.H. Lee
,
M. Nieto-Caballero
,
O.O. Osuolale
,
C.A. Ouzounis
,
M.H. Perlin
,
B. Prithiviraj
,
N. Rascovan
,
A. Różańska
,
L.M. Schriml
,
T. Semmler
,
H. Suzuki
,
J.A. Ugalde
,
B. Young
,
J. Werner
,
M.M. Zambrano
,
Y. Zhao
,
C. Mason
,
T. Shi
Citar
DOI
URL
Antimicrobial Resistance Dynamics in Chilean Shigella sonnei Strains Within Two Decades: Role of Shigella Resistance Locus Pathogenicity Island and Class 1 and Class 2 Integrons
C.S. Toro
,
J.C. Salazar
,
D.A. Montero
,
J.A. Ugalde
,
J. Díaz
,
L.A. Cádiz
,
T. Henríquez
,
C. García
,
P. Díaz
,
R. Camponovo
,
G. Hermosilla
,
M.T. Ulloa
PDF
Citar
DOI
URL
Genetic characterization of clinically relevant class 1 integrons carried by multidrug resistant bacteria (MDRB) isolated from the gut microbiota of highly antibiotic treated Salmo salar
F. Vásquez-Ponce
,
S. Higuera-Llantén
,
J. Parás-Silva
,
N. Gamboa-Acuña
,
J. Cortés
,
A. Opazo-Capurro
,
J.A. Ugalde
,
M. Alcalde-Rico
,
J. Olivares-Pacheco
PDF
Citar
DOI
URL
A global metagenomic map of urban microbiomes and antimicrobial resistance
D. Danko
,
D. Bezdan
,
E.E. Afshin
,
S. Ahsanuddin
,
C. Bhattacharya
,
D.J. Butler
,
K.R. Chng
,
D. Donnellan
,
J. Hecht
,
K. Jackson
,
K. Kuchin
,
M. Karasikov
,
A. Lyons
,
L. Mak
,
D. Meleshko
,
H. Mustafa
,
B. Mutai
,
R.Y. Neches
,
A. Ng
,
O. Nikolayeva
,
T. Nikolayeva
,
E. Png
,
K.A. Ryon
,
J.L. Sanchez
,
H. Shaaban
,
M.A. Sierra
,
D. Thomas
,
B. Young
,
O.O. Abudayyeh
,
J. Alicea
,
M. Bhattacharyya
,
R. Blekhman
,
E. Castro-Nallar
,
A.M. Cañas
,
A.D. Chatziefthimiou
,
R.W. Crawford
,
F. De Filippis
,
Y. Deng
,
C. Desnues
,
E. Dias-Neto
,
M. Dybwad
,
E. Elhaik
,
D. Ercolini
,
A. Frolova
,
D. Gankin
,
J.S. Gootenberg
,
A.B. Graf
,
D.C. Green
,
I. Hajirasouliha
,
J.J.A. Hastings
,
M. Hernandez
,
G. Iraola
,
S. Jang
,
A. Kahles
,
F.J. Kelly
,
K. Knights
,
N.C. Kyrpides
,
P.P. Łabaj
,
P.K.H. Lee
,
M.H.Y. Leung
,
P.O. Ljungdahl
,
G. Mason-Buck
,
K. McGrath
,
C. Meydan
,
E.F. Mongodin
,
M.O. Moraes
,
N. Nagarajan
,
M. Nieto-Caballero
,
H. Noushmehr
,
M. Oliveira
,
S. Ossowski
,
O.O. Osuolale
,
O. Özcan
,
D. Paez-Espino
,
N. Rascovan
,
H. Richard
,
G. Rätsch
,
L.M. Schriml
,
T. Semmler
,
O.U. Sezerman
,
L. Shi
,
T. Shi
,
R. Siam
,
L.H. Song
,
H. Suzuki
,
D.S. Court
,
S.W. Tighe
,
X. Tong
,
K.I. Udekwu
,
J.A. Ugalde
,
B. Valentine
,
D.I. Vassilev
,
E.M. Vayndorf
,
T.P. Velavan
,
J. Wu
,
M.M. Zambrano
,
J. Zhu
,
S. Zhu
,
C.E. Mason
,
N. Abdullah
,
M. Abraao
,
A.-H. Adel
,
M. Afaq
,
F.S. Al-Quaddoomi
,
I. Alam
,
G.E. Albuquerque
,
A. Alexiev
,
K. Ali
,
S. Aly
,
J. Amachee
,
M.G. Amorim
,
M. Ampadu
,
M.A.-F. Amran
,
N. An
,
W. Andrew
,
H. Andrianjakarivony
,
M. Angelov
,
V. Antelo
,
C. Aquino
,
Á. Aranguren
,
L.F. Araujo
,
H.F. Vasquez Arevalo
,
J. Arevalo
,
C. Arnan
,
L.E. Alvarado Arnez
,
F. Arredondo
,
M. Arthur
,
F. Asenjo
,
T.S. Aung
,
J. Auvinet
,
N. Aventin
,
S. Ayaz
,
S. Baburyan
,
A.-M. Bakere
,
K. Bakhl
,
T.F. Bartelli
,
E. Batdelger
,
F. Baudon
,
K. Becher
,
C. Bello
,
M. Benchouaia
,
H. Benisty
,
A.-S. Benoiston
,
J. Benson
,
D. Benítez
,
J. Bernardes
,
D. Bertrand
,
S. Beurmann
,
T. Bitard-Feildel
,
L. Bittner
,
C. Black
,
G. Blanc
,
B. Blyther
,
T. Bode
,
J. Boeri
,
B. Boldgiv
,
K. Bolzli
,
A. Bordigoni
,
C. Borrelli
,
S. Bouchard
,
J.-P. Bouly
,
A. Boyd
,
G.P. Branco
,
A. Breschi
,
B. Brindefalk
,
C. Brion
,
A. Briones
,
P. Buczansla
,
C.M. Burke
,
A. Burrell
,
A. Butova
,
I. Buttar
,
J. Bynoe
,
S. Bönigk
,
K.O. Bøifot
,
H. Caballero
,
X.W. Cai
,
D. Calderon
,
A. Cantillo
,
M. Carbajo
,
A. Carbone
,
A. Cardenas
,
K. Carrillo
,
L. Casalot
,
S. Castro
,
A.V. Castro
,
A. Castro
,
A.V.B. Castro
,
S. Cawthorne
,
J. Cedillo
,
S. Chaker
,
J. Chalangal
,
A. Chan
,
A.I. Chasapi
,
S. Chatziefthimiou
,
S.R. Chaudhuri
,
A.K. Chavan
,
F. Chavez
,
G. Chem
,
X. Chen
,
M. Chen
,
J.-W. Chen
,
A. Chernomoretz
,
A. Chettouh
,
D. Cheung
,
D. Chicas
,
S. Chiu
,
H. Choudhry
,
C. Chrispin
,
K. Ciaramella
,
E. Cifuentes
,
J. Cohen
,
D.A. Coil
,
S. Collin
,
C. Conger
,
R. Conte
,
F. Corsi
,
C.N. Cossio
,
A.F. Costa
,
D. Cuebas
,
B. D'Alessandro
,
K.E. Dahlhausen
,
A.E. Darling
,
P. Das
,
L.B. Davenport
,
L. David
,
N.R. Davidson
,
G. Dayama
,
S. Delmas
,
C.K. Deng
,
C. Dequeker
,
A. Desert
,
M. Devi
,
F.S. Dezem
,
C.N. Dias
,
T.R. Donahoe
,
S. Dorado
,
L. Dorsey
,
V. Dotsenko
,
S. Du
,
A. Dutan
,
N. Eady
,
J.A. Eisen
,
M. Elaskandrany
,
L. Epping
,
J.P. Escalera-Antezana
,
C.L. Ettinger
,
I. Faiz
,
L. Fan
,
N. Farhat
,
E. Faure
,
F. Fauzi
,
C. Feigin
,
S. Felice
,
L.P. Ferreira
,
G. Figueroa
,
A. Fleiss
,
D. Flores
,
J.L. Velasco Flores
,
M.A.S. Fonseca
,
J. Foox
,
J.C. Forero
,
A. Francis
,
K. French
,
P. Fresia
,
J. Friedman
,
J.J. Fuentes
,
J. Galipon
,
M. Garcia
,
L. Garcia
,
C. García
,
A. Geiger
,
S.M. Gerner
,
S.L. Ghose
,
D.P. Giang
,
M. Giménez
,
D. Giovannelli
,
D. Githae
,
S. Gkotzis
,
L. Godoy
,
S. Goldman
,
G.H. Gonnet
,
J. Gonzalez
,
A. Gonzalez
,
C. Gonzalez-Poblete
,
A. Gray
,
T. Gregory
,
C. Greselle
,
S. Guasco
,
J. Guerra
,
N. Gurianova
,
W. Haehr
,
S. Halary
,
F. Hartkopf
,
A. Hawkins-Zafarnia
,
N.H. Hazrin-Chong
,
E. Helfrich
,
E. Hell
,
T. Henry
,
S. Hernandez
,
P.L. Hernandez
,
D. Hess-Homeier
,
L.E. Hittle
,
N.X. Hoan
,
A. Holik
,
C. Homma
,
I. Hoxie
,
M. Huber
,
E. Humphries
,
S. Hyland
,
A. Hässig
,
R. Häusler
,
N. Hüsser
,
R.A. Petit
,
B. Iderzorig
,
M. Igarashi
,
S.B. Iqbal
,
S. Ishikawa
,
S. Ishizuka
,
S. Islam
,
R. Islam
,
K. Ito
,
S. Ito
,
T. Ito
,
T. Ivankovic
,
T. Iwashiro
,
S. Jackson
,
J. Jacobs
,
M. James
,
M. Jaubert
,
M.-L. Jerier
,
E. Jiminez
,
A. Jinfessa
,
Y. De Jong
,
H.W. Joo
,
G. Jospin
,
T. Kajita
,
A.S. Ahmad Kassim
,
N. Kato
,
A. Kaur
,
I. Kaur
,
F. de Souza Gomes Kehdy
,
V.S. Khadka
,
S. Khan
,
M. Khavari
,
M. Ki
,
G. Kim
,
H.J. Kim
,
S. Kim
,
R.J. King
,
G. KoLoMonaco
,
E. Koag
,
N. Kobko-Litskevitch
,
M. Korshevniuk
,
M. Kozhar
,
J. Krebs
,
N. Kubota
,
A. Kuklin
,
S.S. Kumar
,
R. Kwong
,
L. Kwong
,
I. Lafontaine
,
J. Lago
,
T.Y. Lai
,
E. Laine
,
M. Laiola
,
O. Lakhneko
,
I. Lamba
,
G. de Lamotte
,
R. Lannes
,
E. De Lazzari
,
M. Leahy
,
H. Lee
,
Y. Lee
,
L. Lee
,
V. Lemaire
,
E. Leong
,
D. Lewandowska
,
C. Li
,
W. Liang
,
M. Lin
,
P. Lisboa
,
A. Litskevitch
,
E.M. Liu
,
T. Liu
,
M.A. Livia
,
Y.H. Lo
,
S. Losim
,
M. Loubens
,
J. Lu
,
O. Lykhenko
,
S. Lysakova
,
S. Mahmoud
,
S.A. Majid
,
N. Makogon
,
D. Maldonado
,
K. Mallari
,
T.M. Malta
,
M. Mamun
,
D. Manoir
,
G. Marchandon
,
N. Marciniak
,
S. Marinovic
,
B. Marques
,
N. Mathews
,
Y. Matsuzaki
,
V. Matthys
,
M. May
,
E. McComb
,
A. Meagher
,
A. Melamed
,
W. Menary
,
K.N. Mendez
,
A. Mendez
,
I.M. Mendy
,
I. Meng
,
A. Menon
,
M. Menor
,
R. Meoded
,
N. Merino
,
K. Miah
,
M. Mignotte
,
T. Miketic
,
W. Miranda
,
A. Mitsios
,
R. Miura
,
K. Miyake
,
M.D. Moccia
,
N. Mohan
,
M. Mohsin
,
K. Moitra
,
M. Moldes
,
L. Molina
,
J. Molinet
,
O.-E. Molomjamts
,
E. Moniruzzaman
,
S. Moon
,
I. de Oliveira Moraes
,
M. Moreno
,
M.S. Mosella
,
J.W. Moser
,
C. Mozsary
,
A.L. Muehlbauer
,
O. Muner
,
M. Munia
,
N. Munim
,
M. Muscat
,
T. Mustac
,
C. Muñoz
,
F. Nadalin
,
A. Naeem
,
D. Nagy-Szakal
,
M. Nakagawa
,
A. Narce
,
M. Nasu
,
I.G. Navarrete
,
H. Naveed
,
B. Nazario
,
N.R. Nedunuri
,
T. Neff
,
A. Nesimi
,
W.C. Ng
,
S. Ng
,
G. Nguyen
,
E. Ngwa
,
A. Nicolas
,
P. Nicolas
,
A. Nika
,
H. Noorzi
,
A. Nosrati
,
D.N. Nunes
,
K. O'Brien
,
N.B. O'Hara
,
G. Oken
,
R.A. Olawoyin
,
J.Q. Oliete
,
K. Olmeda
,
T. Oluwadare
,
I.A. Oluwadare
,
N. Ordioni
,
J. Orpilla
,
J. Orrego
,
M. Ortega
,
P. Osma
,
I.O. Osuolale
,
O.M. Osuolale
,
M. Ota
,
F. Oteri
,
Y. Oto
,
R. Ounit
,
C.A. Ouzounis
,
S. Pakrashi
,
R. Paras
,
C. Pardo-Este
,
Y.-J. Park
,
P. Pastuszek
,
S. Patel
,
J. Pathmanathan
,
A. Patrignani
,
M. Perez
,
A. Peros
,
S. Persaud
,
A. Peters
,
A. Phillips
,
L. Pineda
,
M.P. Pizzi
,
A. Plaku
,
B. Pompa-Hogan
,
M.G. Portilla
,
L. Posada
,
M. Priestman
,
B. Prithiviraj
,
S. Priya
,
P. Pugdeethosal
,
C.E. Pugh
,
B. Pulatov
,
A. Pupiec
,
K. Pyrshev
,
T. Qing
,
S. Rahiel
,
S. Rahmatulloev
,
K. Rajendran
,
A. Ramcharan
,
A. Ramirez-Rojas
,
S. Rana
,
P. Ratnanandan
,
T.D. Read
,
H. Rehrauer
,
R. Richer
,
A. Rivera
,
M. Rivera
,
A. Robertiello
,
C. Robinson
,
P. Rodríguez
,
N.A. Rojas
,
P. Roldán
,
A. Rosario
,
S. Roth
,
M. Ruiz
,
S.E. Boja Ruiz
,
K. Russell
,
M. Rybak
,
T.S. Sabedot
,
M. Sabina
,
I. Saito
,
Y. Saito
,
G.A. Malca Salas
,
C. Salazar
,
K.M. San
,
J. Sanchez
,
K. Sanchir
,
R. Sankar
,
P.T. de Souza Santos
,
Z. Saravi
,
K. Sasaki
,
Y. Sato
,
M. Sato
,
S. Sato
,
R. Sato
,
K. Sato
,
N. Sayara
,
S. Schaaf
,
O. Schacher
,
A.-L.M. Schinke
,
R. Schlapbach
,
C. Schori
,
J.R. Schriml
,
F. Segato
,
F. Sepulveda
,
M.S. Serpa
,
P.F. De Sessions
,
J.C. Severyn
,
M. Shakil
,
S. Shalaby
,
A. Shari
,
H. Shim
,
H. Shirahata
,
Y. Shiwa
,
O. Da Silva
,
J.M. Silva
,
G. Simon
,
S.K. Singh
,
K. Sluzek
,
R. Smith
,
E. So
,
N. Andreu Somavilla
,
Y. Sonohara
,
N. Rufino de Sousa
,
C. Souza
,
J. Sperry
,
N. Sprinsky
,
S.G. Stark
,
A. La Storia
,
K. Suganuma
,
H. Suliman
,
J. Sullivan
,
A.A.M. Supie
,
C. Suzuki
,
S. Takagi
,
F. Takahara
,
N. Takahashi
,
K. Takahashi
,
T. Takeda
,
I.K. Takenaka
,
S. Tanaka
,
A. Tang
,
Y. Man Tang
,
E. Tarcitano
,
A. Tassinari
,
M. Taye
,
A. Terrero
,
E. Thambiraja
,
A. Thiébaut
,
S. Thomas
,
A.M. Thomas
,
Y. Togashi
,
T. Togashi
,
A. Tomaselli
,
M. Tomita
,
I. Tomita
,
O. Toth
,
N.C. Toussaint
,
J.M. Tran
,
C. Truong
,
S.I. Tsonev
,
K. Tsuda
,
T. Tsurumaki
,
M. Tuz
,
Y. Tymoshenko
,
C. Urgiles
,
M. Usui
,
S. Vacant
,
L.E. Vann
,
F. Velter
,
V. Ventorino
,
P. Vera-Wolf
,
R. Vicedomini
,
M.A. Suarez-Villamil
,
S. Vincent
,
R. Vivancos-Koopman
,
A. Wan
,
C. Wang
,
T. Warashina
,
A. Watanabe
,
S. Weekes
,
J. Werner
,
D. Westfall
,
L.H. Wieler
,
M. Williams
,
S.A. Wolf
,
B. Wong
,
Y.L. Wong
,
T. Wong
,
R. Wright
,
T. Wunderlin
,
R. Yamanaka
,
J. Yang
,
H. Yano
,
G.C. Yeh
,
O. Yemets
,
T. Yeskova
,
S. Yoshikawa
,
L. Zafar
,
Y. Zhang
,
S. Zhang
,
A. Zhang
,
Y. Zheng
,
S. Zubenko
Citar
DOI
URL
An integrative bioinformatic analysis for keratinase detection in marine-derived streptomyces
R. Valencia
,
V. González
,
A. Undabarrena
,
L. Zamora-Leiva
,
J.A. Ugalde
,
B. Cámara
Citar
DOI
URL
Bacteria Isolated From the Antarctic Sponge Iophon sp. Reveals Mechanisms of Symbiosis in Sporosarcina, Cellulophaga, and Nesterenkonia
M. Moreno-Pino
,
J.A. Ugalde
,
J.H. Valdés
,
S. Rodríguez-Marconi
,
G. Parada-Pozo
,
N. Trefault
Citar
DOI
URL
Covid-19 and city: Towards an integrated model of housing, microbiology, environment and urbanism [COVID-19 y ciudad: Hacia un modelo integrado de vivienda, microbiología, ambiente y urbanismo]
F. Encinas
,
K. Soto-Liebe
,
C. Aguirre-Nuñez
,
B. González
,
W. Bustamante
,
A. Schueftan
,
J. Ugalde
,
C. Blondel
,
R. Truffello
,
P. Araya
,
C. Freed
Citar
DOI
URL
Bacterially produced metabolites protect C. elegans neurons from degeneration
A. Urrutia
,
V. García-Angulo
,
A. Fuentes
,
M. Caneo
,
M. Legüe
,
S. Urquiza
,
S.E. Delgado
,
J. Ugalde
,
P. Burdisso
,
A. Calixto
Citar
DOI
URL
Cartography of opportunistic pathogens and antibiotic resistance genes in a tertiary hospital environment
K.R. Chng
,
C. Li
,
D. Bertrand
,
A.H.Q. Ng
,
J.S. Kwah
,
H.M. Low
,
C. Tong
,
M. Natrajan
,
M.H. Zhang
,
L. Xu
,
K.K.K. Ko
,
E.X.P. Ho
,
T.V. Av-Shalom
,
J.W.P. Teo
,
C.C. Khor
,
S.L. Chen
,
C.E. Mason
,
O.T. Ng
,
K. Marimuthu
,
B. Ang
,
N. Nagarajan
,
D. Danko
,
D. Bezdan
,
E. Afshinnekoo
,
S. Ahsanuddin
,
C. Bhattacharya
,
D.J. Butler
,
F. De Filippis
,
J. Hecht
,
A. Kahles
,
M. Karasikov
,
N.C. Kyrpides
,
M.H.Y. Leung
,
D. Meleshko
,
H. Mustafa
,
B. Mutai
,
R.Y. Neches
,
A. Ng
,
M. Nieto-Caballero
,
O. Nikolayeva
,
T. Nikolayeva
,
E. Png
,
J.L. Sanchez
,
H. Shaaban
,
M.A. Sierra
,
X. Tong
,
B. Young
,
J. Alicea
,
M. Bhattacharyya
,
R. Blekhman
,
E. Castro-Nallar
,
A.M. Cañas
,
A.D. Chatziefthimiou
,
R.W. Crawford
,
Y. Deng
,
C. Desnues
,
E. Dias-Neto
,
D. Donnellan
,
M. Dybwad
,
E. Elhaik
,
D. Ercolini
,
A. Frolova
,
A.B. Graf
,
D.C. Green
,
I. Hajirasouliha
,
M. Hernandez
,
G. Iraola
,
S. Jang
,
A. Jones
,
F.J. Kelly
,
K. Knights
,
P.P. Labaj
,
P.K.H. Lee
,
L. Shawn
,
P. Ljungdahl
,
A. Lyons
,
G. Mason-Buck
,
K. McGrath
,
E.F. Mongodin
,
M.O. Moraes
,
H. Noushmehr
,
M. Oliveira
,
S. Ossowski
,
O.O. Osuolale
,
O. Özcan
,
D. Paez-Espino
,
N. Rascovan
,
H. Richard
,
G. Rätsch
,
L.M. Schriml
,
T. Semmler
,
O.U. Sezerman
,
L. Shi
,
L.H. Song
,
H. Suzuki
,
D.S. Court
,
D. Thomas
,
S.W. Tighe
,
K.I. Udekwu
,
J.A. Ugalde
,
B. Valentine
,
D.I. Vassilev
,
E. Vayndorf
,
T.P. Velavan
,
M.M. Zambrano
,
J. Zhu
,
S. Zhu
Citar
DOI
URL
Distinctive gene and protein characteristics of extremely piezophilic Colwellia
L.M. Peoples
,
T.S. Kyaw
,
J.A. Ugalde
,
K.K. Mullane
,
R.A. Chastain
,
A.A. Yayanos
,
M. Kusube
,
B.A. Methé
,
D.H. Bartlett
Citar
DOI
URL
»
Citar
×